电子管风琴专业在2003年开设，电子管风琴，起源于管风琴，因演奏方式与管风琴相似而得名。电子管风琴，具有近千种音色，音质接近真实乐器，可演奏出一个乐队的音响效果，气势恢宏。可以展现多种音乐风格。乐器丰富的音色和强大的功能以及广泛的应用性深得社会各界人士青睐和好评。
电子管风琴师资团队与《电子管风琴演奏》课程先后获批省级重点学科、优秀教学团队以及校级精品课程。在2022年3月获批四川省级本科一流课程。该教学团队主研了10余项国家级、省部级、院级数项科研项目，包括《交响乐数字化探索与实践》、《西南少数民族音乐与电子管风琴的碰撞》等等。该教学团队出版专著、多本教材、发行音像作品并发表了数篇学术论文。
该专业拥有二级教授、四川省学术与技术带头人、四川省学术与技术带头人后备人选、四川音乐学院有突出贡献的教学名师、全国五一劳动奖章、省三八红旗手等雄厚的师资力量和一流的教学设备。拥有研究生、本科、附中三个层次的学生。培养的学生有数百余人次获得了国内外赛事的各种奖项，数十余人次在各类重大国际国内比赛中获得前三名的好成绩。如：在吟飞国际电子管风琴大赛、雅马哈全国电子键盘大赛、亚太国际大赛屡获金奖。特别是在该专业规格最高、难度最大的中国音乐“小金钟”奖的比赛中两次获得了电子管风琴独奏专业组金奖的好成绩。
本专业学生毕业后就业前景也比较广泛，就业方向大部分从事教育及专业团体方面工作。很多学生毕业后已经成为各大音乐院校的骨干教师，还有一部分从事专业文艺院团、广播影视系统，群众文化系统等工作，并且在各类型音乐制作、现场演出、音乐治疗、在各类型教学机构，自主创业开办音乐类企业、工作室等等多个行业都能够找到工作机会，真正成为社会需要的应用型、创新型的人才。